El Atlante ha dejado una marca imborrable en la Liga de Expansión desde su creación, destacando por su desempeño y logros en las finales de los últimos años.
2022 - Campeón de Campeones 2022
Tras coronarse como campeones del torneo Apertura 2021, los Potros de Hierro se enfrentaron a los campeones del torneo Clausura 2022 en un emocionante duelo por el título definitivo de la temporada. A pesar de un resultado desfavorable en el Estadio Ciudad de los Deportes, Atlante logró revertir el marcador en el Estadio Morelos, coronándose como Campeón de Campeones de la temporada 2021/22.
2021 - Campeones Apertura 2021
En solo su tercer torneo en la Liga de Expansión, Atlante se consagró como campeón del Torneo Apertura 2021. En una final que revivió la rivalidad del torneo apertura 2020, Atlante venció al equipo TMFC frente a una multitud de más de 20 mil aficionados en el Estadio Ciudad de los Deportes.
2020 - CDMX
El torneo de Apertura de la Liga de Expansión 2020 marcó el regreso triunfal del Atlante a la Ciudad de México, su verdadera casa. Dirigido por Emilio Escalante y con Mario García como técnico, Atlante llegó a la final contra Tampico Madero en el Estadio Ciudad de los Deportes, en un partido que quedó en la historia a pesar de que el título finalmente fue para la Jaiba Brava.
Con la final alcanzada recientemente contra los tapatíos y victoria ante Leones negros, Atlante suma su quinta final en cuatro años. Además, busca su tercer trofeo de Liga de Expansión, los dirigentes del fútbol mexicano han descartado el regreso del ascenso y descenso, lo que significa que los clubes campeones de la Liga de Expansión deberán conformarse con su posición actual.